Selv om mikroorganismer er generelt ansett som en helsefare, mennesker har et symbiotisk forhold med mange typer mikrober. Samlingen av mikrober som lever i eller på mennesker er noen ganger kalt "flora". I motsetning til mikrobene som forårsaker sykdommer, disse mikrobene er avgjørende for god helse. "Probiotika" er begrep som refererer til "gode" bakterier, og det er mange forskjellige typer mikrober som er bra for mennesker.

Lactobacillus Acidophilus

Lactobacillus acidophilus er en type bakterier som er i stand til å leve i sterkt sure miljøer og produserer melkesyre som et avfallsprodukt. Denne stamme av bakterier kan forårsake tannråte, men ellers er ufarlig for mennesker, og er en del av normal flora. Det er vanligvis oppnådd fra fermenterte meieriprodukter, som acidophilus søt melk og yoghurt. Lactobacillus acidophilus hemmer veksten av candida albicans, en sopp, og kan ha andre helsefordeler.

Bifidobacterium bifidum

Bifidobacterium bifidum er en art av bakterier som finnes som en del av de normale humane tarmflora. Disse bakteriene har en rekke fordeler for menneskers helse, inkludert å hjelpe fordøyelsen og absorpsjon av vitaminer og mineraler, og hindrer vekst av skadelige bakterier og forebygge diaré. Noen typer antibiotika eller mage forhold kan forstyrre balansen av disse bakteriene i tarmen, i så fall, kan ta kosttilskudd som inneholder Bifidobacterium bifidum være gunstig.

Escherichia Coli

Escherichia coli, eller E. coli, er beryktet som en matbåren sykdom. Men det er bare noen få stammer som forårsaker sykdom. De fleste stammer av E. coli er en del av de normale humane tarmflora, og er fordelaktig, å produsere vitamin K og B-kompleks vitaminer og hindrer vekst av skadelige bakterier. En spesiell stamme av E. coli, E. coli Nissle 1917, anvendes for effektivt å behandle kroniske inflammatoriske tarmsykdommer.

Saccharomyces boulardii

Saccharomyces boulardii er en gjær, en type sopp som finnes i indonesiske litchi. Denne gjæren er uvanlig i at det kan overleve magesyre og galle i fordøyelsessystemet og forblir uskadd. Det er først og fremst brukes til å behandle diaré fra flere forskjellige årsaker, men er også brukt som et supplement for vitamin B og protein, som et supplement til behandling av kronisk akne og for å gi ernæringstilskudd til premature barn.