Ikke alle bakterier som er skadelige for mennesker. Et eksempel på gunstige bakterier er Lactobacillus GG. Disse er også kjent som probiotika, og hjelpe på fordøyelsen ved å begrense mengden av bakterier i tykktarmen. Men det er dårlige bakterier, som finnes utenfor kroppen, som ikke bare er skadelig for mennesker, men også dødelig. Noen av disse bakteriene er funnet i elvevannet.

Cyanobakterier

Dr. Charles L. Stoltenow, en forlengelse veterinær ved North Dakota State University, skrev en artikkel om cyanobakterier forgiftning hos dyr som har drukket vann som inneholder en eller flere arter av cyanobakterier. Ifølge Dr. Stoltenow, cyanobakterier, også kjent som blågrønnalger, kan forårsake kramper, blodig diaré og plutselig død hos berørte dyr. Cyanobakterier er fotosyntetiske bakterier, som mener de bruker energien fra solen for å produsere organisk materiale. Fotosyntesen er også hvordan de får deres varemerke, blå-grønne pigment. Cyanobakterier, som finnes i mange vannforekomster, inkludert elvevann, produsere "smak-og-lukt forbindelser." Ifølge USGS Kansas algetoksin Research Team disse cyanobakterier forbindelser har blitt rapportert å forårsake sykdom og død hos mennesker og dyr, i minst 35 amerikanske delstater.

Yersinia enterocolitica Bakterier

Yersinia enterocolitica infeksjon er vanligvis knyttet til inntak av rå eller kokt svinekjøtt, og svinekjøtt produkter. Imidlertid kan Yersinia enterocolitica også overføres til dyr og mennesker i sterkt forurenset elvevann. Symptomer på infeksjon inkluderer feber, magesmerter, og blodig diaré. Ifølge en 1980 studie publisert av det internasjonale iournal Nåværende Microbiology, vol. 4, 24 isolerte stammer av Yersinia enterocolitica ble identifisert fra 46 vannprøver tatt fra små elver over hele Belgia. Disse stammer viste karakteristikker, som var biokjemiske og serologiske i naturen, noe som betyr at bakteriene kontaminering var et direkte resultat av biologisk materiale.

Escherichia coli og streptokokker

Mikroorganismer, slik som koliforme bakterier Escherichia coli og streptokokker, er funnet i elvevannet for en rekke årsaker. Beitedyr kan gjøre sitt fornødne i eller nær elver, som kan bidra til en høy konsentrasjon av fekal bakterier. Andre måter disse bakteriene kan komme inn et vassdrag eller elv vannkilde er gjennom storm avløp og defekte kloakksystemer eller beholdere, for eksempel en offentlig kloakk overløp eller en septiktank lekkasje. Hos mennesker, kan de streptokokker bakterier forårsake revmatisk feber; akutt glomerulonefritt (nyresykdom); skarlagensfeber; bakterier sepsis, kalt Bacteremia; og toksisk sjokksyndrom. Menneskelige koliforme bakterier forgiftning kan føre til kramper, diaré, og i noen tilfeller andre vannbårne sykdommer.