Et antigen er en type molekyl som utløser en respons fra immunsystemet. Vanligvis vil immunsystemet produserer et antistoff til å bekjempe de invaderende substans, enten nøytraliserende eller ødelegge den. Antigener kommer i mange forskjellige former, varierende i både hensikten og sammensetning. Studiet av antigener (gjennom immunologi) er dermed ganske intrikat.

Haptener

Disse små molekyler utløse immunsystemtiltak når festet til større bærere. Bærermolekyler oftest komme i form av et protein. Den kovalente binding mellom disse to molekyler utløser en immunrespons som tidligere ikke var mulig med bare hapten. Urishol, for eksempel, er et hapten genet utskilles fra giftsumak bort passerer dyr. Uten oksidasjon, betyr urishol ikke få oppmerksomheten til menneskets immunsystem; ennå, med vedlegg av oksygen for å danne kinon, ringer denne kjemiske forbindelsen alarmklokkene for antistoffer.

Allergener

Disse kjente antigener er stoffer som forårsaker allergiske reaksjoner fra menneskets immunsystem. Allergener er bemerkelsesverdig i at bare en brøkdel av befolkningen opplever bivirkninger til dem. For disse menneskene, fungerer immunsystemet på en måte som er en stor overreaksjon; Dette all-out angrep på "invaderende" stoffer vondt verten i prosessen. Noen av de mest vanlige allergener er støv, bakterier, pollen, matvarer, medikamenter, og syntetisert kjemikalier (parfymer). For eksempel vil et individ sensitivt for husstøvmidd gi skadelige, og eventuelt fatale, immunologiske reaksjoner ved rundt dem.

Superantigens

En annen type antigen, et superantigen, er en som fremkaller en stor reaksjon fra kroppens immunsystem. Superantigens operere ved å stimulere en rekke T-celler på en gang, alarmerende immunsystemet og å produsere en rekke ikke-spesifikke antistoffer til å motvirke inntrenging. I lekmann vilkår, superantigens arbeid ved å forvirre immunsystemet via aktivering mye T-celler. Immunsystemets forsiktig, spesifikke natur er kastet ut av klask gjennom denne metoden. Siden superantigens er produsert av skadelige mikrober, behandling av slike infeksjoner ofte krever fjerning eller ødeleggelse av midlet. Skarlagensfeber og revmatoid artritt er forbundet med superantigen aktivitet.

Mimotopes

Epitoper er den delen av invaderende antigen som vertsimmunsystemet gjenkjenner. Identifiseringen av en antigen epitop utløser et riktig svar fra kroppen. Etterligne en epitop, og dermed kan være ganske nyttige i antigen-strategi. Mimotopes er makromolekyler som etterligner et antigen epitop, signaliserer en rask respons på kvele "trussel". Mimotopes brukes i vaksiner, slik som for å tilpasse seg kroppen til muligheten for en bestemt infeksjon; dette holder kroppen klar mens ikke skade verten.