Digidexo.com

Sekvensielle Chip Protokoller

Sekvensielle Chip Protokoller


Sekvensiell kromatin immunoutfelling, kjent som SeqChIP, er en biologisk test ment å definere hvordan to proteiner som interagerer innen en region av en deoksyribonukleinsyre (DNA) tråd. Forskere engasjere et bestemt sett av bestilte oppgaver å avsløre tre mulige sammenhenger mellom proteiner som skal utredes. Som med de fleste science tester, det vesener med rengjøring og ender med konklusjonen. Ifølge Harvard forskere, kan teknologiske fremskritt i SeqChIP analyse tillate forskere å bredere studere biologiske fenomener.

Forbered

SeqChIP eksperimenter inneholde grundige forberedelser for å desinfisere og rengjøre magnetiske kuler for eksperimentet. Forskere må vaske perlene flere ganger og rengjør dem i "blokk" løsning. Perlene ble deretter suspendert til tørking og re-vasket. Vanligvis lar forskere en dag før den endelige vaske før du flytter frem til linking scenen. Gitt natur varierende DNA-strengene for vurdering, denne fasen av forberedelsene også varierer i kompleksitet. Imidlertid gjenstår en vitenskapelig sannhet: renere testen, jo renere resultatet.

Cross

Forskere velge DNA-proteinkomplekser, eller områder i strengen, for forsterkning med et antistoff. I kraft, biologer sidestille proteiner for å observere deres interaksjon. Når observert, må kryss-link for å bli bekreftet i omvendt rekkefølge. Må proteiner fortsatt forholde når sekvensen er snudd? SeqChIP forskere mener at sameksistens av både proteiner når vurdert i motsatt retning gi overbevisende bevis for fullført co-belegg, og tillate entydig differensiering av delvis belegg og ingen co-belegg.

Rens

Polymerase Chain Reaction, eller "PCR", er en DNA-amplifikasjon prosess som kontrollerer kvalitet eller renhet av DNA. PCR utføres i tre trinn. Først smelter PCR trådene fra hverandre ved å heve temperaturen. Deretter forskere bringe de to mal tråder tilbake sammen med PCR primere. Til slutt, biologer ruge DNA slik at polymerase primere forårsake celler under eksamen for å klynge. Derfra forskere flytte til undersøkelse av klyngene.

Vurdere

Analyse undersøker DNA-trådene for tilstedeværelse eller fravær av "belegg", en interaktiv forholdet mellom proteiner. To proteiner som alltid forbinder med samme DNA fragment har full co-belegg; ingen co-belegg oppstår når proteinene kan bare knytte i gjensidig eksklusive sub-populasjoner av DNA-tråden; partiell co-belegg betyr at enkelte DNA-molekyler har begge proteiner, mens andre har den ene eller den andre. Hvis SeqChIP testing er en prosedyre i tråd biologi, gir det forskere med mulighet for å bruke enkeltresultatene til en hel genomisk struktur.