Forskere bruker alkalisk lysering for å trekke ut plasmid DNA fra bakterier for bruk i genetiske eksperimenter. Plasmider er små sirkulære molekyler av DNA inneholdende en liten del av genetiske koden for studien.

Hvorfor Alkaline Lysis

Den alkaliske lyseringsprotokoll består av en serie av oppløsninger tilsettes til en bakteriell pellet inneholdende plasmid-DNA. Den økte alkaliteten i løsningen forårsaker at cellene brister. Denne metoden for ekstraksjon beskytter plasmid DNA mens ødelegge den genomiske DNA og denaturerende cellulære proteiner til å gi vitenskapsmann med en relativt ren prøve.

SDS og NaOH

Alkalisk beskriver de to store kjemikalier som brukes til å forårsake lysis av individuelle celler. Natriumdodecylbenzensulfonat (lauryl) sulfat (SDS) er et vaskemiddel som destabilisert cellen ved å lage hull i cellemembranen. Natriumhydroksid (NaOH) legger til å bryte ned celleveggen forårsaker at cellen å gå i oppløsning og slipper sitt genetiske materiale i løsning.

Hvorfor Plasmid DNA Overlever

En ytterligere egenskap av NaOH i den alkaliske lyseringsprotokollen er å forstyrre den hydrogenbinding mellom DNA basepar. Dette denatures genomisk DNA og plasmid DNA til ett og ett hårstrå. Tilsetning av kaliumacetat til oppløsningen nøytraliserer alkalitet og den lille plasmid-DNA er i stand til å re-natur og oppløses i oppløsningen. Genomisk DNA er for stor til å re-natur hele sin lengde. Den og de denaturerte proteinene utfelles ved sentrifugering forlater plasmid DNA i oppløsning.