Bakterier fester seg til en overflate danner komplekse matriseinnebygde samfunn som kalles biofilm. Disse samfunnene er vanskelige å løsne og spille en viktig rolle i utviklingen av infeksjonen. Bakteriene som bebor munnen kan kolonisere tennene til å danne biofilm som kalles plakk. Fordi noen av disse bakteriene forbrenne sukker for å slippe melkesyre som et biprodukt, de skaper et surt miljø i biofilm som livnære mineraler fra tennene. Bevisene antyder fluor kan bidra til å hemme biofilmvekst.

Direkte Hemming

Fluoridioner kan direkte inhibere visse bakterielle enzymer i noen av bakteriene i munnen eller danne metallkomplekser som inhiberer enzymaktiviteten. Fluoridioner imidlertid ikke lett trenge gjennom cellemembraner, slik at graden av denne effekten er beskjeden.

Forsuring

Fluoridioner er et konjugat base av et svakt surt, hydrofluorsyre eller hydrogenfluorid. Miljøet i en biofilm er ofte meget surt på grunn plakkbakterier frigi syrer som et biprodukt av deres metabolisme. Ved disse lave pH-nivåer, likevekten mellom fluoridioner og hydrogenfluorid i oppløsningen forskyves mot hydrogenfluorid, og fluoridioner vil akseptere hydrogenioner til å bli hydrogenfluorid, eller HF. HF er bedre i stand til å trenge inn i bakterielle cellemembraner enn fluoridion, fordi det ikke har noen nettoladning. Når den gjør dette, vil det dissosierer i cellecytoplasmaet å frigjøre hydrogenioner, og dermed en senkning av pH. Denne serien av hendelser som bidrar til å forstyrre syre produksjon av bakterien og øker spenning på bakteriene, bremse eller inhibering av bakterievekst.

Penetrasjon

Den viktigste effekten av fluor er å fremme remineralization på tennene og hemme demineralization. Både effektiviteten av fluor i styrke tennene og hemme bakterievekst er begrenset av begrenset hvilken grad fluor penetrerer biofilm. Ifølge en 2005 studie i Journal of Dental Research, under den korte lengden på tiden du bruker å pusse tennene, ikke fluor ikke har en mulighet til å fullstendig trenge gjennom biofilm, så mens ytre lagene av biofilm motta mer fluor, de som er nærmest til tennene får mindre. Tilbringe mer tid børsting kan bidra til å øke fluor penetrasjon.