Digidexo.com

Om den magnetiske Utvinning av DNA

Selv magnetisk utvinning er ikke alltid den metoden å bruke for din situasjon, har det flere klare fordeler som gjør det situasjons effektiv som en utvinning metode over eldre metoder som fenolekstraksjon som krever gjentatt sentrifugal behandling etter hver bruk av kjemiske midler, og mye mer investert tid. Magnetisk ekstraksjon er hurtigere, fordi den er avhengig av binding bestemte funksjonelle grupper på overflaten av belagte magnetiske kuler, og kan separeres ved bruk av en enkel magnet (som kan være kombinert med sentrifuge bruk, etter ønske).

Magnetiske kuler?

Spesifikke sett med magnetiske perler er vanlig anvendt for ekstraksjon av DNA. Siden hvert system, som inkluderer en mekanisk prosessor for å spare arbeidskraft, kommer med sin egen merkevare, bør du bare bruke perler utformet for et gitt system. Kulestørrelse og belegg kan endre resultater hvis brukt i ulike enheter, som reduserer troverdigheten din forskning. Selv spesielt laget alternativer kan øke eksperimentelle feil og bør gjøres kjent når rapportering av resultater hvis vifte ikke er laget for å fungere med dine spesifikke perler.

Bør jeg "mix og match" Systems I Research?

Systemer som bruker forskjellige perler kan påvirke resultatene. Henderson et al. kom til den konklusjon at av de ni kuletyper testet, kan Dynabeads® DNA DIREKTE ™ av Invitrogen ™ bare plukke opp DNA som har en geometrisk vridd belastende. Dette betyr at de magnetiserte kuler bare beholdt de større biter av DNA. Videre ble det opplyst at DNA måtte være frittflytende (i en løsning). Denne tilstanden også regler det ut for bruk under visse omstendigheter. Dette betyr imidlertid også at dette produktet er en god måte å skille ut den høye molekylvekt DNA (de store stykker) fra lav molekylvekt DNA ("degradert", små eller ødelagte stykker). Poenget i alt dette er at det er alltid opp til forskerne å finne ut hvordan du best kan bruke egenskapene til disse produktene.

Hvorfor bruke magneter for DNA Extraction?

Denne nye metoden kan gjøre ting mer komplisert (logistisk), men de fleste studier med magnetisk utvinning metoden fortsatt bruke fenol som en kontroll og sammenligning, men vanligvis vist en forbedring i hastighet og nøyaktighet ved å redusere eksperimentelle feil gjennom automatisering. Videre gir den magnetiske tilnærming seg til reversibel immobilisering gjennom det automatiske metoder som kan øke effektiviteten av forskningsmidler ved å øke DNA-utbyttet pr løp.

Belegg

Magnetiske kuler kommer i en rekke typer, hvor de kan være belagt med antistoffer som er spesifikt utformet for en type protein eller de kan være mer generalisert med belegg eller aminer, karboksyler, eller andre egnede grupper. Når den kjemiske belegg på magneten har bundet det aktuelle kjemikaliet, bead-bundet kjemikaliene kan deretter hurtig fjernet ved hjelp av en enkelt magnet.

Betyr Size Matter?

Størrelsen påvirker egenskaper som mengden av tid som skal tillates for binding på grunn av overflateareal som øker i mindre kuler. En annen fordel med den mindre vulst er at den gjør en bedre suspensjon, siden partiklene er finere og lettere kan dispergeres. Micro-size perler er mye større (noen ganger så mye som 15 000 ganger større) enn sine nanostørrelse kompiser (som koster mye mer).

Kostnader

Ulempen med denne prosessen er at det er en betydelig kostnad som er involvert i nanokuler siden 5 ml kan kjøre en over $ 400 i butikker. Mikro-sized perler kan være vesentlig billigere, på omtrent en tredjedel av kostnadene, men det gjør arbeidet farten saktere.

Sentrifuger Tubes

Magnetiske separatorer er tilgjengelige som holder sentrifugerør og tillate massen av separering i mange fulle sentrifugerør alt på en gang. Noen av disse holder masse kapasiteter på opp til 24 eller mer sentrifugerør full av materialet på en gang, mens andre bare holde to om gangen. Magneten er vanligvis sentralt i multi tube versjoner og er enten under eller under rørene. Å sette disse rør i en sentrifuge fornuftig grunn av den høye tettheten av kulene som kan hjelpe i den magnetiske separasjonsprosessen. Mer informasjon er tilgjengelig på nettet eller gjennom din lokale leverandør.