Prøver å sette et tall på hvilke typer bakterier i våre fordøyelseskanalen er en utfordring. Ifølge nettstedet typer bakterier, er det ca 300 til 1000 individuelle arter av bakterier som lever i fordøyelsessystemet, med antall levende bakterieceller når over 100 billion til enhver tid. Selv om dette kan høres urovekkende, de fleste er ikke skadelig på noen måte; mange er nyttig og tjene viktige funksjoner i vår evne til å fordøye mat.

E. coli

Escherichia coli (E. coli) bakterier lever i tarmen hos dyr (primært storfe) og mennesker. De fleste stammer av E. coli er harmløse og hjelpe til med fordøyelsen. Vi er avhengige av E. coli for vitamin K og noen av B-kompleks vitaminer; Men de fleste forbinder E. coli med belastningen 0157: H7, som forårsaker sykdom. De fleste tilfeller av E. coli forurensning kommer fra halvsteikt biff eller rå (upasteurisert) melk. Likevel infeksjonen kan også spres når mat er forurenset med fekal bakterier. Symptomer på infeksjon kan vises 7:59 dager etter smitte, og de vanligvis inkluderer kvalme, oppkast og diaré.

Bacteroides

Bacteroides bor i tykktarmen, og er det mest tallrike av normal flora i den delen av fordøyelseskanalen. De er involvert i bruken av nitrogenholdige stoffer, fermentering av karbohydrater, og biotransformasjonen av gallesyrer og andre steroider. Bacteroides er tilpasset å vokse der det ikke er oksygen, og de utgjør ingen trussel mot oss med mindre de får ut av tykktarmen og inn i resten av kroppen vår. Dette kan skje hvis det er en byll, og denne sjeldne forekomsten kan være svært farlig som de fleste Bacteroides er resistente mot mange antibiotika.

Lactobacillus

Lactobacillus acidophilus normalt lever i fordøyelseskanalen og er også til stede i visse matvarer som yoghurt, samt i kosttilskudd. Lactobacillus acidophilus er fordelaktig fordi den produserer laktase, vitamin K og anti-mikrobielle stoffer som acidolphilin, acidolin, bakteriocin og lactocidin. Den brukes for å behandle og forebygge diaré og er betraktet som spesielt effektive i behandling av diaré hos barn forårsaket av rotavirus. Det er også vurdert å være mulig effektivt for å håndtere irritabel tarm syndrom symptomer, diaré hos sykehus voksne og diaré forårsaket av reiser.