Ett felles mål i medisinsk forskning innebærer identifisering av feil eller mutasjoner i DNA sekvens som kan føre til genetisk beslektet sykdom. Teknologi og informatikk har avansert genetisk forskning til et nivå hvor tusenvis av sekvensdata kan analyseres samtidig. En fastsettelse av nyere programvare er konvertering på forhånd av sekvensdata i FASTA format. FASTA ligner på enkel tekstformat. Det gjør at flere biter av data som skal sammenstilles i en enkelt fil og akselererer analyse. Men de fleste instrumenter generere sekvens filer i tekstformat. Konvertere tekst til FASTA format er en enkel prosess ved hjelp av tekst editor programvare.

Bruksanvisning

Åpne utpekt DNA sekvens tekstfil ved hjelp av tekst-redigering program. Dette ville være Text Editor for MacIntosh og Notatblokk for Windows-kompatible systemer. Opprinnelige sekvenstekstfiler kan ha en alternativ utvidelse som seq for data som genereres på en Applied Biosystems automatisert genetisk analysator.

Begynn den første linjen ved å skrive> etterfulgt av en sekvens identifikator. Jo større enn symbolet angir FASTA format for programmer som analyserer fasta data. Det er ingen spesielle regler om identifikasjon, så lenge det ikke er noen mellomrom. Et eksempel på en akseptabel inngang for den første linjen er> Cat_Isomerase_Exon3.

Trykk på "Return" tasten for å lage et linjeskift og begynne den andre linjen.

Begynn sekvensdata på linje to. Fasta retningslinjer format krever DNA tekstdata følgende IUPAC, IUPAC, koder. Hver linje er begrenset til 80 tegn som representerer 80 DNA-baser og kan være store eller små bokstaver. En akseptabel oppføring inkludert blandede baser er AGCTTCGTGG ... CVTGCGTTGT.

Trykk på "Return" tasten for å starte neste linje av sekvensdata. Hver linje skal bestå av 80 baser representert ved IUPAC-koden.

Lagre filen ved hjelp av txt filtype eller passende FASTA filtypen. Programmer som behandler FASTA formatert data krever ofte en FASTA spesifikk utvidelse som FSA, fna, ffn eller FRN.