Menneskekroppen kan være hjem til mange forskjellige typer organisme, fra mikroskopiske til parasitter som kan sees med det blotte øye. Organismene som forårsaker sykdom kan normalt lever på eller i kroppen, eller de kan infisere kroppen på et tidspunkt, og holde seg i live i årevis.

Gastrointestinal Commensal Flora

Mennesket har bakterier i fordøyelsessystemet for å bryte ned mat og konvertere det til næringsstoffer, og de har også sopp og bakterier som vokser i andre deler av mage-tarmkanalen, så som munnen, halsen og vagina. Organismer som disse er kjent som commensals, slik de vanligvis gjør ingen skade på sin vert og er sunt å ha.

Områder av legemet som for eksempel de indre organer, blod og nedre luftveier i lungene vanligvis ikke inneholde noen organismer. Selv om resten av legemet kan være befolket av mikroorganismer som forårsaker ingen skade, og til mikroorganismene ende opp et sted de skal ikke være. ?? For eksempel kan bakterien Haemophilus influenzae bor stille i halsen og bare føre til sykdom når den kommer inn i lungene. En sopp som heter Candida bor vanligvis på slimhinner i skjeden trygt, men hvis antibiotika drepe av organismer som lever sammen med den, kan Candida vokse ut av kontroll og forårsake trost.

Hud Commensal Flora

Bakterier som Staphylococcus arter lever vanligvis harmløst på huden. Hvis huden blir ødelagt, kan de bakteriearter komme under det ytre beskyttende lag av huden og danner en infeksjon. Eksempelvis bor arten Staphylococcus aureus på omtrent tre av ti personer. Det kan forårsake sykdommer slik som abscesser, blodforgiftning og toksisk sjokksyndrom.

Latente infeksjoner

Noen mikroorganismer kan infisere en person og forblir levende i kroppen i år eller i en mannsalder. For eksempel, kan viruset som forårsaker forkjølelsessår, kjent som herpes simplex, trekke seg tilbake til nerveceller mellom angrep og holde sovende i en mannsalder. Vannkopper er et annet virus som infiserer noen når han er ung og deretter gjemmer seg i nervecellene, reaktivere i noen mennesker mange år senere for å forårsake helvetesild. Hepatitt C-viruset kan holde skjult i flere tiår før forårsaker skrumplever eller leverkreft.

Parasitter

Parasitter kan leve i kroppen i årevis uten å forårsake gjenkjennelig sykdom. For eksempel, FNs barnefond anslo i 2002 at mer enn tre milliarder mennesker verden over ble smittet med rundorm, hookworm eller whipworm. Ormene ikke føre til akutt sykdom, men kan stunt veksten av barn, føre til kronisk diaré eller føre til anemi.