Gel elektroforese er en måte for å skille DNA-fragmentene i henhold til deres størrelse. Du til sporings fargestoff til hver DNA-prøve for å hjelpe deg å se prøven og for å spore fremdriften av DNA-fragmentene gjennom gel.

Betydning

For å skille fragmenter av DNA, med det formål å måle deres størrelse eller for å isolere et bestemt fragment, forskere satte DNA i en agarosegel neddykket i en løsning som er ladet med en elektrisk strøm. Den aktuelle skyver DNA-fragmentene gjennom gelen, og fordi gelen er porøs, mindre DNA-fragmenter orm seg gjennom raskere. De reiser lenger enn større fragmenter i samme tidsperiode.

Formål

DNA er fargeløst når det er i oppløsning i et reagensrør. For at prøven lettere å se, både i reagensglasset og i gelen legger man et farget sporingsfargestoff til prøven. Fargestoffet påvirker ikke DNA i det hele tatt.

Sporing

Den vanlige sporende farvestoff er bromfenolblå i en 50-prosent glycerol-løsning. Bromfenolblå farger prøven lyse blå, slik at det er lett å spore fremgang gjennom gelen. Når det sporende farvestoff har reist omtrent 3/4 av lengden av gelen, er det tid for å slå av den elektriske strømmen.

Tetthet

Den sporende farvestoff er tett på grunn av sin høye konsentrasjon av glycerol. Det gjør DNA-prøvene synke inn i laste spor av gelen, i stedet for å flyte i løsningen ovenfor gel som bærer den elektriske strømmen.

Dye Migration

Bromfenolblå vandrer gjennom en agarose løsning på omtrent samme hastighet som en DNA-tråd som inneholder 300 basepar. Hvis du ønsker å spore fremdriften av større DNA-trådene, kan du bruke en sporing fargestoff med xylen cyanol, som vandrer på omtrent samme hastighet som en DNA-tråd med 4000 basepar.