Ulike typer bakterier, kjent som enteriske patogener, kan forårsake tarmsykdom. For å diagnostisere en infeksjon, må det kliniske laboratorium skille mellom de bakterier som forårsaker sykdommen og de bakterier som normalt er funnet i tarmen. For å gjøre dette, laboratorier stole på bakteriekulturer, immunologi tester, spesielle flekker og karbohydrat bruke tester.

Bakteriekultur

Bakteriekulturer er fortsatt gullstandarden (mest pålitelige) test for å identifisere bakterier fra en avføringsprøve. En liten del av avføringsprøve er plassert i petriskåler med forskjellige typer nærings-mediet. Dette bidrar til å identifisere hva slags bakterier i tarmen avhengig av deres ernæringsmessige behov og hvilke retter de vokser inn.

Immunologi tester

Noen tester for bakterier i tarmkanalen innebære bruk av antistoffer som er spesifikke for visse bakteriearter. En bit av avføringsprøven er plassert på en glass-slide, og antistoff-oppløsningen tilsettes til den. Hvis bakterien som antistoffene er rettet er i prøven, vil det oppstå klumper.

Spesielle flekker

Forskjellige bakterier flekken forskjellige farger og er av forskjellige former når det sees under mikroskopet. Den klassiske flekken er Gram flekken. De fleste "gode" bakterier i tarmen er Gram-negative, beising rosa. Mange av de "dårlige" bakterier i tarmen, som Clostridium er Gram-positive, flekker lilla.

Karbohydrat utnyttelse

Ulike bakterier bruke ulike typer karbohydrater (sukker). Karbohydrat utnyttelse (Bruk) tester hjelpe både test for tilstedeværelse av bakterier i en avføringsprøve og for å identifisere hvilke bakterier er de som er. Små prøver av avføring er plassert i rør med forskjellige karbohydrater. Som bakteriene bruker de karbohydrater, deres avfallsprodukter endrer surhet i rørene, forårsaker en fargeendring.

Molekylærbiologiske tester

Den neste generasjonen av tester for alle typer bakterier, intestinal eller på annen måte, omfatter det som kalles "molekylær biologi." Dette er testing for tilstedeværelse av bakteriens arvestoff. Det er mange ganger når bakteriene ikke vil vokse i petriskåler, fordi de er skadet på tidspunktet for innsamling. Molekylærbiologiske tester krever bare det genetiske materialet for å være i prøven, ikke levedyktige bakterier.