Bakterier er blant de mest tallrike og mangfoldig gruppe av organismer på planeten. Det avgjørende bakteriologi anvender en rekke nærings-og biokjemiske tester for å identifisere bakterier. Tradisjonelt har disse metodene ofte krevde omfattende tid til kultur, isolere og teste bakterier. Imidlertid har de siste teknologiske fremskritt tillatt raske deteksjonsmetoder skal utvikles.

Farging

Gramfarging blir ofte anvendt som et innledende trinn i bakteriell identifikasjon og bruker en flekk, decolorizer, og farge for å identifisere bakterier i henhold til deres cellevegg. Andre fargemetoder inkluderer syrefaste flekker, spore flekker og negativ farging.

Cellemorfologi

Når sett under mikroskopet, kan bakterier bli kategorisert i henhold til formen av deres celler. Disse former inkluderer bacilli (stavformet) bakterieceller og cocci (sfæriske formede bakterieceller).

Nutrient Agar

Bakterier er ofte samtidig på flere agar retter hver inneholder varierende næringsstoffer. Bakterier kan bli videre isolert av de næringsstoffer som kreves for veksten, koloni morfologi, og i noen tilfeller, stoffer som inhiberer veksten.

Biokjemiske tester

Reaksjonen av bakterier til visse stoffer som kan hjelpe til med identifikasjon. For eksempel detekterer en katalaseprøve nærvær av katalase enzymet ved tilsetning av hydrogenperoksyd og observere for dannelsen av oksygenboblene.

Serologisk

Antistoffer kan benyttes for å påvise svært spesifikke proteiner i en bakterie. Dette har muliggjøre utvikling av agglutinasjon tester, ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay), og Western Blot.

DNA

I økende grad er metoder blir utviklet og ansatt som tillater bakterier å bli identifisert i henhold til genetiske markører innenfor sitt genom. Disse metodene gir mulighet for mye raskere identifisering og en betydelig mengde av automatisering til bakteriell identifikasjon.